Rayman 3D is de zoveelste remake van Rayman 2: The Great Escape. In dit tweede deel in de Rayman-franchise vallen de robotpiraten The Heart of the World aan, waardoor zij gemakkelijk de wereld kunnen veroveren. Rayman laat dit natuurlijk niet zomaar gebeuren en dus gaat hij op zoek naar Polokus, de geest van de wereld. Om hem te verslaan moet Rayman op zoek naar vier verschillende maskers die verspreid liggen in The Glade of Dreams. In deze wereld vol droomplaatsen komt hij onder andere in een onderwaterwereld, een vulkaan en uiteindelijk ook op een enorm piratenschip terecht, terwijl hij verschillende nieuwe personages tegenkomt.