In Spongebob de Onnozele Krabbelaar beleef je het meest gekke en creatieve avontuur tot nog toe en kan je meer dan honderd kleine spelletjes (nanogames) spelen in zes grappige werelden. In een hoog tempo komen spelletjes voorbij die je zo snel mogelijk moet uitvoeren. Niet alleen kom je Spongebob tegen zoals je 'm al kent, maar ook verschijnen er nieuwe Spongeys, waaronder Pixel Bob, Punk Rock Bob en Comic Book Bob.
Tijdens het avontuur moet je veelvuldig tekenen, kleuren en creatief doen. Naast het avontuur van Spongebob de Onnozele Krabbelaar kan je tekeningen van de gele spons verzamelen.

De 3ds versie van het spel wordt bestuurd door de spelcomputer te kantelen, schudden of gebruik te maken van het aanraakscherm. Voor de Wii versie is een uDraw teken tablet nodig.